MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Acidiphilium cryptum JF-5 chromosome

Total Repeats: 90347

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
2501	NC_009484	GGGC	2	8	102491	102498	0 %	0 %	75 %	25 %	148259112
2502	NC_009484	CAG	2	6	102519	102524	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148259113
2503	NC_009484	CTT	2	6	102536	102541	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	148259113
2504	NC_009484	CCA	2	6	102557	102562	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148259113
2505	NC_009484	GCC	2	6	102563	102568	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148259113
2506	NC_009484	GCC	2	6	102588	102593	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148259113
2507	NC_009484	TGA	2	6	102631	102636	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148259113
2508	NC_009484	CGG	2	6	102658	102663	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148259113
2509	NC_009484	CGC	2	6	102685	102690	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148259113
2510	NC_009484	GCTGC	2	10	102722	102731	0 %	20 %	40 %	40 %	148259113
2511	NC_009484	CGT	2	6	102733	102738	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148259113
2512	NC_009484	CCG	2	6	102754	102759	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148259113
2513	NC_009484	CGT	2	6	102772	102777	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148259113
2514	NC_009484	GCG	2	6	102870	102875	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148259113
2515	NC_009484	GAA	2	6	102905	102910	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	148259113
2516	NC_009484	CGG	2	6	102925	102930	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148259113
2517	NC_009484	CGG	2	6	102997	103002	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148259113
2518	NC_009484	GCA	2	6	103018	103023	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148259113
2519	NC_009484	GCC	2	6	103074	103079	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148259113
2520	NC_009484	GGAGG	2	10	103112	103121	20 %	0 %	80 %	0 %	148259113
2521	NC_009484	GGA	2	6	103188	103193	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	148259113
2522	NC_009484	GCT	2	6	103234	103239	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148259113
2523	NC_009484	TCTG	2	8	103263	103270	0 %	50 %	25 %	25 %	148259113
2524	NC_009484	CG	3	6	103361	103366	0 %	0 %	50 %	50 %	148259113
2525	NC_009484	GAT	2	6	103367	103372	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148259113
2526	NC_009484	GA	3	6	103446	103451	50 %	0 %	50 %	0 %	148259113
2527	NC_009484	GCT	2	6	103474	103479	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148259113
2528	NC_009484	GCC	2	6	103520	103525	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148259113
2529	NC_009484	GCCGGC	2	12	103583	103594	0 %	0 %	50 %	50 %	148259113
2530	NC_009484	CGT	2	6	103607	103612	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148259113
2531	NC_009484	GCT	2	6	103680	103685	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148259113
2532	NC_009484	CAG	2	6	103706	103711	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148259113
2533	NC_009484	CCA	2	6	103796	103801	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148259113
2534	NC_009484	TGC	2	6	103833	103838	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148259113
2535	NC_009484	TCC	2	6	103844	103849	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	148259113
2536	NC_009484	AGC	2	6	103956	103961	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148259113
2537	NC_009484	GTG	2	6	103962	103967	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148259113
2538	NC_009484	CTGAA	2	10	104048	104057	40 %	20 %	20 %	20 %	148259113
2539	NC_009484	CCT	2	6	104090	104095	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	148259113
2540	NC_009484	GCC	2	6	104240	104245	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148259114
2541	NC_009484	CGC	2	6	104253	104258	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148259114
2542	NC_009484	GCG	2	6	104263	104268	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148259114
2543	NC_009484	CGG	2	6	104297	104302	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148259114
2544	NC_009484	CGA	2	6	104336	104341	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148259114
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2546	NC_009484	GGC	2	6	104477	104482	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148259114
2547	NC_009484	GAC	2	6	104488	104493	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148259114
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2549	NC_009484	CATG	2	8	104580	104587	25 %	25 %	25 %	25 %	148259114
2550	NC_009484	CTG	2	6	104605	104610	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148259114
2551	NC_009484	GCCGT	2	10	104628	104637	0 %	20 %	40 %	40 %	148259114
2552	NC_009484	ATT	2	6	104651	104656	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	148259114
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2554	NC_009484	CGA	2	6	104691	104696	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148259114
2555	NC_009484	GGC	2	6	104706	104711	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148259114
2556	NC_009484	GCGG	2	8	104849	104856	0 %	0 %	75 %	25 %	148259114
2557	NC_009484	GC	3	6	105007	105012	0 %	0 %	50 %	50 %	148259115
2558	NC_009484	GCA	2	6	105066	105071	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148259115
2559	NC_009484	CCG	2	6	105076	105081	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148259115
2560	NC_009484	CAG	3	9	105094	105102	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148259115
2561	NC_009484	CAG	2	6	105109	105114	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148259115
2562	NC_009484	CG	3	6	105120	105125	0 %	0 %	50 %	50 %	148259115
2563	NC_009484	CCG	2	6	105155	105160	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148259115
2564	NC_009484	CGC	2	6	105217	105222	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148259115
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2566	NC_009484	GAA	2	6	105258	105263	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	148259115
2567	NC_009484	CGAG	2	8	105279	105286	25 %	0 %	50 %	25 %	148259115
2568	NC_009484	GAGC	2	8	105306	105313	25 %	0 %	50 %	25 %	148259115
2569	NC_009484	CCCGG	2	10	105369	105378	0 %	0 %	40 %	60 %	148259115
2570	NC_009484	GAT	2	6	105397	105402	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148259115
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2572	NC_009484	CG	3	6	105446	105451	0 %	0 %	50 %	50 %	148259115
2573	NC_009484	GTA	2	6	105490	105495	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148259115
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2576	NC_009484	GCCA	2	8	105525	105532	25 %	0 %	25 %	50 %	148259115
2577	NC_009484	ATG	2	6	105721	105726	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148259115
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2579	NC_009484	TC	3	6	106071	106076	0 %	50 %	0 %	50 %	148259116
2580	NC_009484	GGC	2	6	106113	106118	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148259116
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2582	NC_009484	ACG	2	6	106294	106299	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148259116
2583	NC_009484	GTG	2	6	106308	106313	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148259116
2584	NC_009484	TGA	2	6	106328	106333	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148259116
2585	NC_009484	TCT	2	6	106355	106360	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	148259116
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2587	NC_009484	CCG	2	6	106384	106389	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148259116
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2589	NC_009484	TGAT	2	8	106483	106490	25 %	50 %	25 %	0 %	148259116
2590	NC_009484	GGT	2	6	106539	106544	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148259116
2591	NC_009484	CGG	2	6	106579	106584	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148259116
2592	NC_009484	GCC	2	6	106616	106621	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148259116
2593	NC_009484	GGCC	2	8	106693	106700	0 %	0 %	50 %	50 %	148259116
2594	NC_009484	GCG	2	6	106706	106711	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148259116
2595	NC_009484	CCGGC	2	10	106777	106786	0 %	0 %	40 %	60 %	148259116
2596	NC_009484	CAGGCG	2	12	107216	107227	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	148259117
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2599	NC_009484	GAT	2	6	107520	107525	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148259118
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2601	NC_009484	CAT	2	6	107555	107560	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148259118
2602	NC_009484	CCG	2	6	107574	107579	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148259118
2603	NC_009484	TC	3	6	107585	107590	0 %	50 %	0 %	50 %	148259118
2604	NC_009484	GC	5	10	107603	107612	0 %	0 %	50 %	50 %	148259118
2605	NC_009484	GTG	2	6	107614	107619	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148259118
2606	NC_009484	CGT	2	6	107652	107657	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148259118
2607	NC_009484	GCA	2	6	107743	107748	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148259118
2608	NC_009484	GCA	2	6	107842	107847	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148259118
2609	NC_009484	GCCGTC	2	12	107864	107875	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	148259118
2610	NC_009484	TGC	2	6	107934	107939	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148259118
2611	NC_009484	GC	3	6	107938	107943	0 %	0 %	50 %	50 %	148259118
2612	NC_009484	TCG	2	6	107964	107969	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148259118
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2614	NC_009484	GCA	2	6	108043	108048	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148259118
2615	NC_009484	GC	3	6	108049	108054	0 %	0 %	50 %	50 %	148259118
2616	NC_009484	CGCC	2	8	108106	108113	0 %	0 %	25 %	75 %	148259118
2617	NC_009484	CGT	2	6	108169	108174	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148259118
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2619	NC_009484	TCG	2	6	108225	108230	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148259118
2620	NC_009484	ATC	2	6	108263	108268	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148259118
2621	NC_009484	CAG	2	6	108326	108331	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148259118
2622	NC_009484	CCG	2	6	108333	108338	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148259118
2623	NC_009484	G	6	6	108589	108594	0 %	0 %	100 %	0 %	148259119
2624	NC_009484	ACCGG	2	10	108726	108735	20 %	0 %	40 %	40 %	148259119
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2634	NC_009484	TGA	2	6	110185	110190	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148259120
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2728	NC_009484	AT	3	6	116638	116643	50 %	50 %	0 %	0 %	148259127
2729	NC_009484	ATCAG	2	10	116710	116719	40 %	20 %	20 %	20 %	148259128
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2741	NC_009484	CGA	2	6	117233	117238	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148259128
2742	NC_009484	AAG	2	6	117362	117367	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	148259128
2743	NC_009484	GCT	2	6	117385	117390	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148259128
2744	NC_009484	AGC	2	6	117446	117451	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148259128
2745	NC_009484	GCT	2	6	117467	117472	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148259128
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2747	NC_009484	ATTG	2	8	117521	117528	25 %	50 %	25 %	0 %	148259128
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2764	NC_009484	CGC	2	6	119420	119425	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148259129
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2768	NC_009484	TGA	2	6	119493	119498	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148259129
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2770	NC_009484	CTG	2	6	119643	119648	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148259129
2771	NC_009484	TGC	2	6	119799	119804	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148259129
2772	NC_009484	CTG	2	6	119820	119825	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148259129
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2854	NC_009484	GA	3	6	124502	124507	50 %	0 %	50 %	0 %	148259134
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2983	NC_009484	GC	3	6	131111	131116	0 %	0 %	50 %	50 %	148259138
2984	NC_009484	CATC	2	8	131120	131127	25 %	25 %	0 %	50 %	148259138
2985	NC_009484	GAT	2	6	131139	131144	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148259138
2986	NC_009484	TCC	2	6	131155	131160	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	148259138
2987	NC_009484	CGC	2	6	131161	131166	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148259138
2988	NC_009484	GCA	2	6	131192	131197	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148259138
2989	NC_009484	TCA	2	6	131212	131217	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148259138
2990	NC_009484	CCG	2	6	131241	131246	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148259138
2991	NC_009484	CGC	2	6	131274	131279	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148259138
2992	NC_009484	GCG	2	6	131282	131287	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148259138
2993	NC_009484	TCG	2	6	131293	131298	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148259138
2994	NC_009484	GCG	2	6	131349	131354	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148259138
2995	NC_009484	CGG	2	6	131396	131401	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148259138
2996	NC_009484	CG	3	6	131402	131407	0 %	0 %	50 %	50 %	148259138
2997	NC_009484	CGG	2	6	131411	131416	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148259138
2998	NC_009484	GCG	2	6	131425	131430	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148259138
2999	NC_009484	GC	3	6	131442	131447	0 %	0 %	50 %	50 %	148259138
3000	NC_009484	CGT	2	6	131509	131514	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148259139

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